欧李AP2基因家族的鉴定与表达分析

作者:张晓旭; 郭彩珍; 穆霄鹏; 郭夕雯; 王鹏飞; 汪泽文; 曹琴; 杜俊杰
更新时间:

本研究基于李属植物的全基因组和转录组数据,确定了欧李AP2家族的基因。结果表明,欧利有17个AP2家族成员的基因,它们都有两座AP2结构域。氨基酸的数目为356~854,分子量为4092.00~93434.48,k D和等电点的数目为4.81~9.37,它们不规则地分布在五条染色体上。二级结构主要是无规则卷曲。据亚细胞定位称,ChAP2-7存在于细胞质中,ChAP2-3、ChAP2-6、ChAP2-11和ChAP2-15存在于细胞核中。聚类分析将其分为三类:AP2、euANT和basal ANT。其中,ChAP2-14距离At5g67180最近,ChAP2-16距离At2g28550最近,ChAP2-10距离At3g54320最近。总的来说,AP2家族的17个基因在不同组织和品种中的表达存在较大差异。AP2-4和AP2-6在不同的组织中表达,但AP2-2和AP2-3在不同的组织中不表达。AP2-4和AP2-6在“农大4号”水果中高度表达,而在“农大5号”水果中几乎没有表达。本研究结果为进一步研究欧李AP2基因家族的生物学功能和利用提供了参考。