果生刺盘孢(Colletotrichum fructicola)中CfRab7和CfRas2基因的克隆及生物信息学分析

作者:周陆苏; 朱俊子; 钟杰
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本研究以果果炭疽菌为材料,筛选并获得了小GTP结合蛋白基因Rab7和ras2的同源mRNA序列。用RT-PCR扩增cfrab7基因和cfras2基因的CDs序列,并用生物信息学软件进行分析。结果表明,cfrab7基因的开放阅读框(ORF)全长205 BP,编码205个氨基酸,分子量为50。72  KD,理论等电点为5.13。它具有亲水性,不属于跨膜蛋白,不存在信号肽。它主要位于细胞质中,含有21个磷酸化位点和Rab7特异性异位位点。cfras2基因的ORF长度为645  BP,编码214个氨基酸,分子量为52。53 的KD理论等电点为5.12,为亲水性,不属于跨膜蛋白,不存在信号肽。它主要位于细胞质中,含有19个磷酸化位点和小的GTPase特异性异位位点。氨基酸同源性和进化的比较分析表明,cfrab7和cfras2与炭疽菌等真菌中的Rab7和ras2蛋白具有90%以上的相似性。进化分析表明,cfrab7和cfras2与间进化关系的物种基本一致,炭疽菌相应的蛋白质聚集在一簇。