基于分子对接与数据挖掘探讨生姜解半夏毒的相关机制
作者:李浩然; 李维英; 吴宏赟; 彭伟; 周嘉培
更新时间:
目的:基于分子对接和数据挖掘技术,研究半夏生姜解毒机理。方法:通过系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)搜索生姜的有效成分,并通过TargetSwiss-Prediction数据库预测生姜的目标成分。通过Swiss-model同源建模半夏凝集素后,进行了分子对接。通过DisGeNET数据库获得与炎症相关的靶点,通过基因定位获得生姜治疗炎症的靶点。String被用来构建蛋白质-蛋白质相互作用目标网络(PPI)并筛选关键基因。对目标基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:筛选出5种生姜活性成分,并与半夏凝集素有较强的结合能力。生姜有49个炎症靶点和15个关键靶点,包括MMP9、HSP、90AA1、PPARG、RELA、APP、ICAM1、MMP2、mTOR等。通过GO和KEGG的富集分析,49个靶点基因参与急性炎症反应、炎症反应的调节、炎症介质、,T细胞的活化和淋巴细胞迁移的生物学过程,主要集中在Th17细胞分化相关的途径中。结论:生姜能抑制巴方的毒性成分,通过减轻炎症反应发挥解毒作用。