宣和猪PID1基因外显子3的SNP检测及其与肉质性状的关联分析
[目的]研究PID1号基因多态性对高山猪肉质性状的影响。【方法】选用119头宣和猪为实验材料。通过对PCR产品的直接测序,检测PID1号基因外显子3的SNP基因座。采用最小二乘模型分析各突变位点基因型和单倍型组合的肉质性状差异。[结果]在高山猪PID 1基因外显子3中检测到4个SNP基因座,分别为TC(T253643C)253643 BP,GC(G25675C)253675BP,Ag(a253734g)253734BP和GA(g253827a)253827BP。在四个SNP基因座中检测到三种基因型,其中等位基因T、G、G、a的频率最高,TT、GC、Ag和AA的频率最高。四个SNP基因座中有9个单倍型和24个单倍型组合,其中CGGA单倍型和CGGA/TCAA单倍型组合的频率最高。所有这些都是中度多态性,处于哈迪-温伯格平衡(P>0.05),范围为0.4490至0.499705),遗传多样性相对富裕。G253675C位点与大理石花纹得分显著相关。GC基因型能显著改善大理石花纹评分(P<0.05),且该基因型失水率、熟肉率和滴水损失率最高。A253734g基因座与失水率和IMF含量显著相关,Ag基因型可显著降低失水率(P<0.05),GG基因型可显著增加IMF含量(P<0.05)。g253827a基因座与失水率之间存在显著相关。GG基因型能显著降低失水率(P<0.05),该基因型在大理石纹表现最好,熟肉率最高。在单倍型组合中,TCAA/TCAA组合的失水率最高,大理石得分、熟肉率和IMF含量最低。CGGA单倍型具有改善大理石花纹评分、熟肉率和IMF、减少失水率的效果。[结论]研究结果进一步丰富了PID 1基因的SNP标记,初步证实PID 1基因对宣和猪肉质性状有一定影响,为利用PID1基因标记在实际生产中改良宣和猪肉质性状提供了科学依据。