bta-miR-377琼脂糖凝胶电泳条件优化

作者:郝琴琴; 任静; 成俊丽; 李鹏飞
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bta-miR-377与下丘脑分泌的可卡因苯丙胺调节转录肽(CART)有关。为了分析bta-miR-377在牛下丘脑中的表达,为后续研究bta-miR-377与CART的相互作用及其影响牛卵泡发育的机制奠定基础,采用Trizol法提取牛下丘脑总蛋白,并用茎环结构法设计特异性引物,采用半定量RT-PCR技术克隆人btamiR-377(bta-miR-377)在不同条件下观察琼脂糖凝胶电泳战争后Marker和目标带的分离情况。凝胶浓度分别为2.0%和2.5%。电压分别为100伏和80伏,时间分别为40、60和80min。同时,利用Katar软件对灰度值不同条件下获得的bta-miR-377条带进行了分析,结合电泳结果,确定了最佳分离条件。结果表明,茎环结构法的使用可以达到延长bta-miR-377脉片段的目的,具有很强的特异性。当凝胶浓度为2.5%、电压为80 V、时间为80 min时,bta-miR-377条带分离效果好,表达量高。在此条件下,该条带的灰度值与其他组有显著差异,这与电泳分析结果一致,表明低浓度凝胶的分辨率较低。长期高压将导致DNA的退化和谱带的分散。然而,在适当的电压下,电泳时间过短会使DNA分子无法聚集,谱带过宽。这表明合适的电泳条件是鉴定miRNA蛋白表达的关键。综上所述,btamiR-377脉在牛下丘脑中表达,丰富了动物生殖生理学中下丘脑-垂体-性腺轴的内分泌调节理论。