广东地区猪A型塞内卡病毒USA/GBI29/2015-like株的分离鉴定与进化分析

作者:董建国; 饶丹; 焦凤超; 陈斌; 易本驰; 黄立; 赵攀登; 何书海
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为了了解广东地区猪A型塞内卡病毒(SVA)的遗传变异,采用病毒分离纯化、间接免疫荧光、增殖动力学、电镜观察等方法确定疑似疾病材料的感染情况。同时,利用序列比对分析与GenBank具有代表性的(SVA)全基因组序列进行同源性分析,利用MEGA6.0软件构建全基因组系统发育进化树。结果表明,孤立的病毒能与SVA多克隆抗体公司发生特异性反应。病毒粒子呈球形,直径25~30nm。一种名为CH-GDZQ-1.CH-GDZQ-1毒株的SVA毒株菌株被成功分离。病毒滴度在感染PK15细胞15小时达到峰值1108.78 TCID50/ml。CH-GDZQ-1全基因组序列和美国/gbi29/2015之间的核苷酸相似性为98.1%,高度同源,该菌株与中国-毒株-CH-GDLZ01-2017(MG428680)、CH-GD-LZ02-2017(MG428681)、CH-GDQC-2017(MG428682)、CH-GDYD-2017(MG428683)、CH-GDYS01-2017(MG428684)和CH-GDYS02-2017(MG428685)处于同一进化分支中,与美国菌株USA/GBI29/2015(KT827251)处于同一大分支中。这表明,已成功分离出一株USA/GBI29/2015-like毒株毒株,该毒株病毒滴度高,在广东地区流行。