目的分析HLA－DQ单核苷酸多态性与婴儿牛奶蛋白过敏（CMPA）的相关性。方法回顾性收集2020年1月至8月杭州市儿童医院确诊的80例CMPA组CMPA患儿和80例健康婴儿（对照组）。统计两组患者的基本临床资料。实时荧光定量PCR被用来分析HLA－DQ单核苷酸多态性。采用多元logistic回归分析探讨CMPA的危险因素。结果共有160名婴儿被纳入本研究。CMPA组婴儿的纯母乳喂养时间显著短于对照组，而家族过敏史和HLA－DQA1基因频率显著高于对照组（P<0.05），有过敏家族史（OR=2.99，95%可信区间：1.721~15.193）和HLA－DQA1基因型（OR=10.412，95%可信区间：5.010~21.636）是婴儿CMPA发生的独立危险因素。纯母乳喂养4个月是儿童CMPA发生的保护因素（OR=0.405，95%可信区间：0.306~0.775）。结论HLA-DQ单核苷酸多态性与婴儿CMPA的发生有关，HLA-DQA1基因型可能是CMPA的易感基因型。