龙虾科物种线粒体基因组特征和系统发育分析

作者:朱雷宇; 朱志煌; 朱陇强; 林琪
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通过对Palinuridae龙虾科13种龙虾的线粒体基因组全序列的综合分析,发现线粒体基因组的长度为15470~16105,bp,a+T含量为62.63%~67.11%。Ka/Ks分析表明,龙虾科10种龙虾属(Panulirus)线粒体中13个蛋白质编码基因(PCGs)的Ka/Ks小于1,显示出较强的纯化选择性。在差异异位位点分析中,发现nd5、nd4和rrnL基因的差异位点比例较高,这是一个理想的选择,可以用来分析不同群体龙虾的遗传多样性。密码分析表明编码的氨基酸人的偏好是相似的。同时,本研究采用ML(maximumlikelihood)和BI(Bayesian inference)的方法构建系统发育树。结果表明,塔斯马尼亚(Sagmariasus)的龙虾物种首先开始分化,而龙虾是一个单独的分支,是脊龙虾(Linuparus)/游泳龙虾(Puerulus)的姐妹。贝叶斯的分子钟估计表明,龙虾物种可能起源于三叠纪,然后进一步分化为具有现代特征的龙虾物种。为本研究中龙虾种类的快速鉴定提供了可靠的理论依据。